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登記及年費：客戶須於登記貿易通服務時整筆過繳付登記費。另外，客戶亦須繳付政府電子貿易服務年費，當中包括進出口報關單、電子貨物艙單、產地來源證及應課稅品許可證服務。客戶可參照註三以了解政府電子貿易服務年費之詳情。另外，用戶如申請使用一些包含政府收費之服務，如進出口報關單及產地來源證時，則須繳交一項不計算利息在內但可發還之按金，而金額則以所選擇之結算期用量為基礎。如用戶取消服務，按金將可獲發還。
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首次登記費－2024 年特別優惠：此特別優惠適用於新貿易通客戶。
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政府電子貿易服務年費(包括進出口報關單、電子貨物艙單、產地來源證及應課稅品許可證)－2024 年特別優惠：此特別優惠適用於貿易通客戶登記使用任何一項貿易通之政府電子貿易服務；客戶登記使用超過其中一項服務，年費特別優惠為港幣 946 元。年費將於每年年頭以自動轉帳形式收取，年費繳交後恕不退還。
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交易收費：屬於貿易通的政府或商業文件服務處理費，包括一切有關之交易訊息，如修正、重遞及取消等。該些收費並未包括政府收費。
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應課稅品許可證申請：透過選用固定年期計劃，客戶可享貿易通的專用電子應課稅品許可證申請服務。
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電子貨物艙單：透過選用固定年期計劃，鐵路、遠洋及內河運載商可享貿易通的專用電子貨物艙單服務。另外，航空類艙單的特別優惠收費為每份港幣 16 元。
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貿易通道路貨物資料系統：電子預報貨物資料(e-ACI)及辦理捆綁手續按每宗交易收取劃一費用。貿易通亦為客戶提供港幣 240 元優惠月費計劃，包 30 條 e-ACI 及/或 辦理捆綁手續交易，其後每宗交易按用量收取收費。貿易通亦提供其他優惠收費計劃及多元化增值及配套方案，包括捆綁狀況短訊(SMS)增值服務等。
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自動艙單服務(AMS)至美國海關：客戶需繳付港幣 2,300 元的首次登記費。
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進口商安全申報及承運人附加要求(ISF 10+2)至美國海關：以 Excel 文件格式遞交資料之客戶，需繳付港幣 2,300 元的一次過首次登記費。而選擇直接連接系統之客戶，請致電貿易通營業熱線索取有關報價。
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預先申報業務規則(AFR)至日本海關：客戶需繳付港幣 2,300 元的首次登記費。
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貿易通服務站收費：客戶若以紙張文件方式將有關資料送交貿易通服務站或其他合作機構，或以郵遞方式辦理各項報關或相關服務，貿易通將會額外收取文件服務處理費及政府費用。該收費包括將客戶遞交的紙張文件資料轉換成電子數據交換格式，並傳送至政府。
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有關服務包括把紙張報關表格轉換至電子格式，並傳送至政府。服務費用包括將客戶遞交的紙張文件資料轉換成電子格式，但不包括貿易通文件服務處理費及政府費用。
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基本收費已包括兩張提單。若有關提單超過兩張，每張額外提單須另繳付港幣 17.1 元。
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收費包括處理客戶以紙張表格形式提交預報貨物資料 及/或 辦理捆綁手續。貿易通亦因應客戶以傳真或電話等其他渠道遞交預報貨物資料 及/或 辦理捆綁手續而收取有關的附加費。
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貿易通安排專人到客戶指定的地址收取紙張報關表格，並把紙張報關表格轉換至電子格式並予以傳送至政府。該項收費包括上門收取報關表格及將紙張文件資料轉換成電子格式，但不包括貿易通文件服務處理費及政府費用。
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客戶毋需填寫任何報關表格，貿易通會安排專人上門收取客戶有關的付運文件，並從文件中提取相關資料，為客戶準備報關的電子訊息，以傳送至政府報關。該費用包括從付運文件提取相關資料及數據輸入的處理費，但不包括貿易通文件服務處理費及政府費用。
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貨保通服務：客戶透過該網上平台購買貨運保險不需繳付服務費，有關保費會經由貿易通支付給保險代理。
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現有客戶如欲額外訂購軟件，貿易通將就每套軟件收取港幣 400 元。
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上門技術支援：如客戶在操作貿易通軟件時發生問題，需要貿易通提供上門技術支援服務，而該等問題由貿易通系統或軟件損壞所致，貿易通將免費為客戶提供上述服務。惟問題屬用戶本身機件或操作軟件不當所造成，貿易通將會向客戶收取每次港幣 800 元的上門維修服務費。
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貿易通軟件安裝：因應客戶系統環境的複雜性，部份軟件安裝可通過網絡遙距進行。貿易通將會向客戶收取每次港幣 520 元的遙距安裝服務費。
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加設電子郵箱：在首次登記時，每一位用戶可免費設立一個電子郵箱。如要求加設電子郵箱，每一個郵箱之加設費為港幣 510 元。每一個加設郵箱的年費為港幣 295 元，年費將於每年年頭收取。
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電郵通知服務：此服務為客戶在處理報關上帶來更多方便。客戶登記服務時，只需提供一個電郵地址，貿易通在每次收到錯誤訊息或政府查詢時，即可向該電郵地址發出有關通知。客戶可享首三個月免費服務。
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額外的簽署鑰匙：貿易通可按其獨有酌情權，於用戶登記日起計的三個月內，向新登記用戶免費贈送壹套由電子核證服務有限公司發出的 ID-Cert (類別一)。用戶如需額外 ID-Cert 或於三個月限期後申請新的 ID-Cert，則需額外繳付此費用。
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替換現有加密鑰匙：所有使用貿易通軟件的客戶將獲免費提供一套加密鑰匙，以設立一個電子郵箱，作為加密/解密訊息之用。不論在任何理由下，客戶如需替換任何加密鑰匙，將需繳付此項費用。
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派送 ID-Cert：貿易通可免費派送一次ID-Cert到新登記客戶指定香港境內之辦公地點。不論在任何理由下如需額外派送 ID-Cert，及需派送其後更新的 ID-Cert，均要收取費用。
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加設帳戶：在首次登記時，貿易通會為用戶提供一個帳戶，如用戶在登記時或以後要求加設帳戶(每一帳戶預設一個電子郵箱)，需為每一個帳戶繳付加設費港幣 1,020 元。每一個加設帳戶的年費為港幣 550 元，年費將於每年年頭收取。
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帳目表：所有用戶將獲發電子形式的帳目表，用戶亦可以透過貿易通電子貿易專網 www.tradelink-ebiz.com 查核帳目表。如客戶因商業上需要，可申請帳目表單據副本或重發電子帳目表，每張手續費為港幣 34 元。
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驗證帳目表正本：客戶如有需要，可申請驗證帳目表正本，每張手續費為港幣490元。
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以支票或銀行存款收據結算帳目：如因各樣原因貿易通未能經客戶銀行自動轉帳結算帳目，而客戶須以支票或銀行存款收據作繳款，貿易通將向客戶收取手續費。為免存疑，此費用不適用於以轉數快及電子支票結算。
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簽發支票行政費：貿易通會收取以支票形式退還款項(包括但不限於帳戶內之按金結餘) 的行政費用。此項收費將自動從退款中扣除。若該退還款項總額等於或低於這項收費，貿易通會將退還款項沒收，而不會另行通知。為免存疑，此費用不適用於貿易通以電子支票退款。
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驗證交易紀錄正本：客戶如有需要，可申請驗證交易紀錄正本，每張手續費為港幣 470 元。
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驗證核查紀錄正本：客戶如有需要，可申請驗證核查紀錄正本。每張手續費為港幣 470 元。
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操作培訓課程：收費適用於由貿易通為用戶提供之操作培訓課程。
